Évaluation de contrôle biologique exercé par les Bacillus spp. sur la cercosporiose de la betterave

Des bactéries du genre Bacillus sont capables de lutter contre certains organismes phytopathogènes. Dans le cadre du projet WACOBI, plusieurs espèces de ce genre bactérien ont été isolées de sols belges et caractérisées. Parmi celles-ci, B. simplex 10B-B9, B. pumilus 30B-B2, B. subtilis 30B-B6, B. mycoides 13A-B3 ainsi que B. mycoides 15A-B2 ont montré un intérêt particulier pour contrôler le mildiou ainsi que l’alternariose des solanacées. L’objectif de ce mémoire est d’évaluer le potentiel de contrôle biologique exercé par ces cinq souches de Bacillus sur un autre pathosystème majeur de Belgique : la cercosporiose de la betterave. Des hypothèses quant aux modes d’action de ces bactéries ont également été établies lors de ce travail. Afin d’atteindre cet objectif, différentes manipulations ont été réalisées. Tout d’abord, des confrontations in vitro entre les bactéries et le champignon ont permis de démontrer que les cinq souches bactériennes réduisent drastiquement la croissance de C. beticola. Plusieurs bio-essais en serre ont ensuite été mis en place afin d’évaluer le potentiel de biocontrôle de ces bactéries sur le développement de la cercosporiose in planta. Des surnageants de cultures bactériennes de B. pumilus 30B-B2 et B. subtilis 30B-B6 ont été produits dans du milieu GA. L’application foliaire du surnageant de B. subtilis 30B-B6 a permis de réduire significativement l’infection par C. beticola. Les lipopeptides, plus précisément la fengycine, pourraient être à l’origine de la protection observée. L’effet des bactéries sur la stimulation des défenses de la plante a également été évalué. Tant la souche B. subtilis 30B-B6 que B. simplex 10B-B9 ont réduit significativement les symptômes de cercosporiose. Les lipopeptides ainsi que les composés volatils produits par ces bactéries pourraient être impliqués dans la stimulation des voies de défenses de la plante. Ce mémoire a permis de confirmer l’intérêt des Bacillus spp. et tout particulièrement de la souche B. subtilis 30B-B6 pour lutter contre la cercosporiose de la betterave.