Étude de la prévalence des résistances aux antibiotiques chez les bactéries du sol et du fumier

La résistance aux antibiotiques est une menace grandissante pour la santé humaine et l’utilisation d’antibiotiques sur le bétail pourrait contribuer significativement à l’émergence de pathogènes résistants. Dans ce contexte, ce mémoire a exploré la diversité des bactéries et de leur(s) résistance(s) au sein d’échantillons de sol et de compost afin de fixer des conditions expérimentales propres à la capture de plasmides conjugatifs environnementaux. Il a aussi cherché à étudier des bactéries multirésistantes isolées dans les premières manipulations. Les milieux de culture et les conditions d’incubation ont été modulés afin d’augmenter la fraction de bactéries cultivables des échantillons. Certaines combinaisons d’antibiotiques pour lesquelles peu de résistances ont été observées ont été retenues, de même que certains milieux de culture, températures et concentrations en dioxygène, afin d’agrandir le réservoir potentiel de plasmides conjugatifs pouvant être étudiés en conditions expérimentales. Sept bactéries résistantes ont été isolées à partir d’un compost de Louvain-la-Neuve et identifiées par séquençage du gène de leur ARNr 16S. Parmi elles, P. rettgeri, M. odoratimus et D. acidovorans sont reconnues comme étant des pathogènes environnementaux émergents et multirésistants, principalement responsables de maladies nosocomiales ou d’infections chez des patients immunodéprimés.