Impact des lipopeptides et des sidérophores produits par Bacillus subtilis 30B-B6 sur l’induction des défenses de la tomate contre Alternaria solani

Divers microorganismes ont été identifiés pour leurs capacités à protéger les cultures contre les agents pathogènes. Ils constituent une alternative à l’utilisation de pesticides synthétiques. La souche bactérienne Bacillus subtilis 30B-B6 a été isolée en Belgique et son potentiel d’action pour lutter contre certaines maladies en Solanacées a été observé lors du projet WACOBI. Cette souche est capable d’induire les défenses de la tomate contre l’alternariose. Cette induction est potentiellement liée aux métabolites produits par ces bactéries. Parmi ceux-ci, les lipopeptides ainsi que les sidérophores semblent jouer un rôle prépondérant. L’intérêt de ce mémoire est d’investiguer l’implication de ces deux métabolites dans l’induction des défenses de la tomate contre A. solani ainsi que leurs potentielles interactions. Les différentes extractions de lipopeptides et de sidérophores (LPS) réalisées dans le cadre de ce mémoire ont permis l’amélioration de la technique d’extraction ainsi que la mise en place de pistes supplémentaires d’optimisation. L’évolution des symptômes d’A. solani sur des plants de tomate traités avec une culture de B. subtilis 30B-B6 d’une part et, des extraits de lipopeptides et de sidérophores produits par cette souche d’autre part ont démontré leur potentielle implication dans l’induction des défenses. Afin d’établir un lien entre la dynamique des profils hormonaux et l’évolution des symptômes, un échantillonnage dans le temps, après l’inoculation avec le pathogène, a été effectué. Les analyses n’ont malheureusement pas pu aboutir suite à l’émergence de l’épidémie du Covid-19. Cependant plusieurs pistes sont proposées afin d’explorer les voies de défenses induites dans les plantes. Premièrement, un suivi de l’évolution de certains hormones et gènes identifiés comme marqueurs des voies de défenses constituerait une première évaluation de l’induction des défenses. En second lieu, la quantification de peroxyde d’hydrogène et d’enzymes antioxydantes permettrait d’évaluer l’implication d’un système d’oxydation et de désoxydation dans la mise en place des défenses des plantes. Les lipopeptides et les sidérophores produits par la souche B. subtilis 30B-B6 semblent être des métabolites prometteurs pour la protection des cultures de tomates contre l’alternariose. Leurs modes d’action ainsi que les réactions induites au sein des végétaux sont encore à élucider.